Rafael Márquez Álvarez durante su carrera como futbolista profesional participó en 5 mundiales con México.

• Copa Mundial de Corea del Sur y Japón 2002 (Octavos de final)
• Copa Mundial de Alemania 2006 (Octavos de final)
• Copa Mundial de Sudáfrica 2010 (Octavos de final)
• Copa Mundial de Brasil 2014 (Octavos de final)
• Copa Mundial de Rusia 2018 (Octavos de final)