Los caimanes llegan a la madurez sexual cuando tienen entre cuatro y diez años de edad, según la especie.

El momento de la temporada de cría también depende de la especie: los caimanes de anteojos se reproducen durante la temporada de lluvias en mayo y junio, y los caimanes negros se reproducen durante la estación seca.

Las hembras construyen montículos de nidos a partir de vegetación o barro que pueden medir hasta 1.5 metros de altura. Luego se colocan entre 30 y 65 huevos en un orificio cónico hecho en la parte superior del montículo que eclosionan después de unos tres meses. Las caimanes hembras guardan sus nidos durante este tiempo, y se sabe que las hembras caimán de anteojos ponen huevos en el mismo nido que guardan juntos.

Cuando escuchan a las crías llamar, los caimanes hembra ayudan a sus crías llevándolas al agua con la boca. Los caimanes hembra permanecen con sus crías hasta por un año para protegerlas de los depredadores.

Los caimanes jovenes son de color más claro que los adultos, pero estas marcas se desvanecen a medida que el caimán envejece, viven juntos en grandes grupos.