El pingüino emperador es la especie más grande de pingüino, tanto en altura como en peso.
Los pingüinos emperadores adultos alcanzan entre 1,15 y 1,22 m de altura. Los pingüinos emperador más grandes pueden llegar a pesar entre 40 y 45 kg. Los machos pesan más que las hembras.
El cuerpo del pingüino emperador tiene forma de torpedo. Esto minimiza el arrastre y permite al pingüino nadar sin esfuerzo a través del agua.