Alrededor del 27% de la superficie es boscosa. Pastizales y matorrales se encuentran en todo el país. Hay maderas blandas autóctonas en las zonas mejor regadas, con bambú y cedros en el monte. Las coníferas de hoja perenne también crecen en las tierras altas. El mopane, el baobab, la acacia y la caoba se encuentran en elevaciones más bajas. Hay más de 3700 especies de plantas que se encuentran en todo el país.

Hay muchas variedades de vida animal. El elefante, la jirafa y el búfalo se encuentran en ciertas áreas. Los hipopótamos habitan en las orillas del lago Malawi. Otros mamíferos en Malawi son el babuino, el mono, la hiena, el lobo, la cebra, el león, el tejón, el jabalí, el antílope y el puercoespín. A principios del siglo XXI se contabilizaron alrededor de 195 especies de mamíferos.

Hay al menos 219 especies de aves. Los reptiles son abundantes e incluyen tortugas de agua dulce, cocodrilos, tortugas marinas, camaleones, lagartos y muchas variedades de serpientes. Los peces abundan en los lagos y ríos, las especies incluyen dorada, lubina, bagre, fango, perca, carpa y trucha. El mbuna es un pez tropical protegido dentro de las aguas del Parque Nacional del Lago Malawi.