La proximidad del mar Báltico influye en el clima costero. En el punto más occidental, Vilsandi Saar, la temperatura media es de 6 grados. En los puntos más orientales del país, la temperatura media es de 4 grados. Las precipitaciones promedian 50 cm en la costa. En el interior, la precipitación promedio es de 70 cm. Las precipitaciones son más fuertes durante el verano y más ligeras en la primavera.