El nitrógeno orgánico y el nitrógeno inorgánico ocurren en el ambiente (suelo, sistemas acuáticos y aire).

La diferencia clave entre el nitrógeno orgánico e inorgánico es que el nitrógeno orgánico es el nitrógeno que se produce en los compuestos orgánicos, mientras que el nitrógeno inorgánico es el nitrógeno que se produce en los compuestos inorgánicos.

A diferencia de los compuestos orgánicos, los compuestos inorgánicos no contienen carbono e hidrógeno como componentes esenciales. Estos compuestos tienen muchos otros elementos químicos y pueden o no contener carbono e hidrógen.

El nitrógeno orgánico incluye aminoácidos, proteínas, nucleótidos, etc. junto con nitrógeno unido a residuos de materia vegetal y animal en descomposición.

El nitrógeno inorgánico incluye principalmente amonio (NH4 +), nitratos (NO3–), nitrógeno (N2) y nitritos (NO2–).