Un virus es una partícula infecciosa compuesta por el genoma del ácido nucleico y una cápside proteica.
Los viroides son partículas infecciosas compuestas solo de moléculas de ARN de cadena simple.
Los virus infectan todo tipo de organismos vivos, incluidos animales y humanos, en cambio los viroides infectan solo a las plantas superiores.
Los viroides son más pequeños que los virus.
Otra diferencia significativa entre virus y viroides es que los viroides carecen de cápsides de proteínas, por lo tanto, no producen proteínas durante la replicación.