La diferencia clave entre la espermatogénesis y la ovogénesis es que la espermatogénesis es la formación de espermatozoides (gametos masculinos), mientras que la ovogénesis es la formación de óvulos (gametos femeninos).

Tanto la espermatogénesis como la ovogénesis se conocen comúnmente como gametogénesis. La gametogénesis es la serie de divisiones mitóticas y meióticas que aparecen en las gónadas, para formar gametos. La producción de gametos es muy diferente entre hombres y mujeres; así, la producción de gametos en los machos se llama espermatogénesis, mientras que en las hembras se llama oogénesis.

La espermatogénesis es la formación de espermatozoides (gametos masculinos). Ocurre en los testículos masculinos. En contraste, la ovogénesis es la formación de óvulos (gametos femeninos). Ocurre en los ovarios. La espermatogénesis comienza a partir de un espermatocito primario y produce cuatro espermatozoides funcionales, mientras que la ovogénesis comienza a partir de un ovocito primario y produce un óvulo único. El tamaño de las células que producen también es otra diferencia; los espermatozoides son más pequeños en tamaño, mientras que el óvulo es una célula grande. Además, los espermatozoides son móviles, mientras que el óvulo es inmóvil.

La citogénesis en la espermatogénesis da como resultado dos células iguales, mientras que la citogénesis en la oogénesis produce dos células altamente desiguales. La espermatogénesis involucra una fase de crecimiento corto y ocurre continuamente después de la pubertad, mientras que la oogénesis involucra una fase de crecimiento largo y ocurre en un patrón cíclico.