El sulfonato es un anión que tiene la fórmula química R-SO3−, mientras que el sulfato es un anión que tiene la fórmula química SO4−2.
La diferencia clave entre sulfonato y sulfato es que el sulfonato es un anión que se forma a partir del ácido sulfónico, mientras que el sulfato es un anión que se forma a partir del ácido sulfúrico.