La diferencia clave entre el sistema de archivos y la base de datos es que el sistema de archivos administra solo el acceso físico, mientras que la base de datos administra el acceso físico y lógico a los datos.
La base de datos y el sistema de archivos son dos métodos que ayudan a almacenar, recuperar, administrar y manipular datos. Ambos sistemas permiten al usuario trabajar con datos de manera similar. Un sistema de archivos es una colección de archivos de datos sin procesar almacenados en el disco duro, mientras que una base de datos está diseñada para organizar, almacenar y recuperar fácilmente grandes cantidades de datos. En otras palabras, una base de datos contiene un conjunto de datos organizados en forma digital para uno o más usuarios.