La diferencia clave entre la hiperconjugación y el efecto inductivo es que la hiperconjugación explica la interacción entre los enlaces sigma y los enlaces pi, mientras que el efecto inductivo explica la transmisión de una carga eléctrica a través de una cadena de átomos.

La hiperconjugación estabiliza la molécula a través de la deslocalización de electrones pi, en cambio el efecto inductivo estabiliza la molécula mediante la transmisión de cargas eléctricas a través de la molécula.

Ambos términos hiperconjugación y efecto inductivo son efectos electrónicos en compuestos orgánicos que conducen a la estabilización del compuesto.