El clima varía según la región. La mayor parte de la costa está formada por bosques húmedos tropicales, cada vez más húmedos hacia el norte. La corriente fría de Humboldt (también llamada corriente peruana), que fluye hacia el norte a lo largo de la costa de Perú y luego se dirige hacia el Pacífico frente a la costa del centro de Ecuador, limita la lluvia en una franja de la costa norte. En el área de Guayaquil hay dos estaciones, un período de lluvias cálidas que dura de enero a mayo. Y una estación seca más fresca, durante el resto del año, cuando las brisas marinas modifican el calor ecuatorial. Los bosques tropicales de Oriente, al este de los Andes, son más húmedos que la costa. Allí, las temperaturas son altas y la lluvia cae todo el año.

El clima de la meseta central se rige principalmente por la altitud. La capital, Quito, a 2850 metros, tiene una primavera perpetua, con una temperatura promedio de 13 grados y alrededor de 127 cm de precipitación anual. Las tierras altas están cortadas por numerosos valles profundos, que llevan los climas subtropicales a unas pocas millas de las zonas más templadas. El frío y el viento aumentan a medida que las laderas que rodean la meseta central ascienden para formar el páramo o prado de las tierras altas. Las áreas más altas se elevan a picos por encima de 5200 metros y están perpetuamente cubiertos de nieve.