El clima es tropicalmente cálido y húmedo en las regiones más bajas del oeste y centro, con frecuentes lluvias fuertes desde octubre o noviembre hasta mayo al sur del ecuador y de abril a junio y de septiembre a octubre en el norte, mientras que a lo largo del ecuador solo hay una temporada.

Las temperaturas promedian 24 grados con alta humedad y casi sin variación estacional. La precipitación anual es de entre 130 cm y 200 cm. En las mesetas norte y sur hay estaciones húmedas y secas, con temperaturas ligeramente más frescas en esta última y una precipitación anual de 100 a 160 cm. Las tierras altas del este tienen temperaturas promedio de 18 a 24 grados, según la temporada. Las precipitaciones promedian de 120 a 180 cm.