Aunque Nigeria se encuentra totalmente dentro de la zona tropical, existen amplias variaciones climáticas en diferentes regiones del país. Cerca de la costa, las estaciones no están bien definidas. Las temperaturas rara vez superan los 32 grados, pero la humedad es muy alta y las noches son calurosas. En el interior, hay dos estaciones distintas, una estación húmeda de abril a octubre, con temperaturas generalmente más bajas, y una estación seca de noviembre a marzo, con temperaturas al mediodía que superan los 38 grados pero noches relativamente frescas. En la meseta de Jos, las temperaturas son más moderadas.

La precipitación promedio a lo largo de la costa varía de unos 180 cm en el oeste a unos 430 cm en ciertas partes del este. En el interior, disminuye a alrededor de 130 cm en la mayor parte del centro de Nigeria y solo 50 cm en el extremo norte.

Dos corrientes de viento principales afectan a Nigeria. El harmattan, desde el noreste, es cálido y seco y acarrea un polvo rojizo del desierto, causa altas temperaturas durante el día y noches frescas. El viento del suroeste trae tiempo nublado y lluvioso.