Guinea-Bissau tiene una gran variedad de vegetación, con una jungla espesa en las llanuras interiores, campos de arroz y manglares a lo largo de las llanuras costeras y pantanos, y sabanas en el norte.

Se encuentran varias especies de antílopes, búfalos, monos y serpientes. A principios del siglo XXI se contabilizaron al menos 108 especies de mamíferos, 235 especies de aves y más de 1000 especies de plantas en todo el país.