Las plantas y animales tropicales y semitropicales se caracterizan más por su variedad que por su abundancia. En la selva tropical de las cordilleras montañosas superiores, se encuentran pinos y helechos, así como caoba, cedro, palisandro y abeto. El café, el cacao y los árboles de coco y las frutas tropicales nativas como el aguacate, la naranja, la lima y el mango crecen en forma silvestre.

Abundan muchas especies de insectos, pero no hay mamíferos grandes ni serpientes venenosas. Patos, gallinas de Guinea y cuatro variedades de palomas silvestres son abundantes. Garzas y flamencos viven en los lagos interiores. La vida reptil incluye tres variedades de cocodrilo, numerosas lagartijas pequeñas y la boa rosa. En las aguas costeras abundan los peces espada, la barracuda, los peces gato y el pargo rojo.

A principios del siglo XXI había al menos 20 especies de mamíferos, 62 especies de aves y más de 5200 especies de plantas en todo el país.