La flora y fauna del país es similar a Tayikistán. Hay varios tipos de flores silvestres en los valles. En las montañas se pueden encontrar yaks, cabras montesas y leopardos de las nieves. El país afirma tener el mayor bosque de nogales de crecimiento natural del mundo. Numerosas bandadas de aves migratorias pasan por el país cada año. A principios del siglo XXI había al menos 83 especies de mamíferos, 168 especies de aves y más de 4500 especies de plantas en todo el país.