Aparte de pequeños parches aislados, queda poco bosque en Benín. Las plantaciones de coco de la franja costera dan paso a palmas de aceite y palmas más roncas que crecen tan al norte como Abomey. A su vez, estas plantaciones son seguidas por un bosque de sabana, en el que se entremezcla la vegetación del bosque de Guinea y la vegetación del sur de Sudán, y luego por la característica sabana sudanesa. Los árboles incluyen el cocotero, palma de aceite, palma ronier, ébano, nuez de karité y kapok entre otros.

Entre los mamíferos de Benín se encuentran el elefante, el león, la pantera, el mono y el cerdo salvaje, así como muchos tipos de antílopes. Los cocodrilos y muchas especies de serpientes están ampliamente distribuidas. La perdiz, la gallina de Guinea y el pato salvaje, así como muchos tipos de aves tropicales, son comunes. Los insectos incluyen variedades de la mosca tsetse y otros vectores de enfermedades epidémicas.