El catolicismo romano es la religión oficial del estado, pero hay libertad de culto para todas las religiones. Se estima que el 95% de la población es católica romana, con aproximadamente el 63% practicando activamente. La mayoría de los protestantes en el país no son malteses. Los jubilados y vacacionistas británicos y de otros países tienden a formar la población protestante. Los testigos de Jehová, la Iglesia de Jesucristo de los Santos de los Últimos Días, la Fraternidad de Iglesias Evangélicas y la Iglesia Bautista Bíblica tienen grupos activos en la isla. Hay una mezquita musulmana y una congregación judía. El budismo zen y la fe bahá’í también están representadas.