Jürgen Norbert Klopp nació el 16 de junio de 1967 en Stuttgart, la capital de Baden-Württemberg, Alemania. Creció en Glatten. Su padre, Norbert Klopp, vendió clavijas y accesorios para las paredes para ganarse la vida. Klopp tiene dos hermanas mayores. El padre de Klopp fue deportista. También impartió entrenamiento físico a su hijo. Cuando era niño, Klopp practicaba esquí en invierno, tenis en verano y fútbol durante todo el año.

Klopp jugó para el TuS Ergenzingen, como junior. Más tarde, jugó para el 1. FC Pforzheim. Durante su adolescencia, Klopp jugó para tres clubes de fútbol de Frankfurt. En 1995, recibió un diploma en ciencias del deporte de la Universidad Goethe de Frankfurt.