Pep Guardiola nació el 18 de enero de 1971, en Santpedor, España. Sus padres fueron Valenti, un albañil, y Dolors, una ama de casa. Tenía dos hermanas mayores y un hermano menor, que nació pocos años después.
Antes de unirse a la academia juvenil del FC Barcelona, era un adicto al fútbol y jugaba cada vez que tenía la oportunidad.
A la edad de 13 años, fue admitido en la academia juvenil del FC Barcelona. Comenzó su carrera profesional en el fútbol como defensor, y durante los siguientes seis años, perfeccionó sus habilidades con el objetivo de verse a sí mismo como parte del primer equipo.
Johan Cruyff lo incluyó en el primer equipo en 1990, cuando Pep tenía 19 años de edad.