Durante el proceso de embriogénesis, la formación de la blástula es seguida por la gástrula, por lo que ambas representan una etapa diferente de la formación de embriones.

La blástula y la gástrula se forman a través de diferentes procesos. La blástula se forma a través de la blastulación, mientras que la gástrula se forma a través de la gastrulación.

La blástula y la gástula se forman a través de diferentes velocidades de divisiones mitóticas. La blástula se forma a través de divisiones mitóticas rápidas del cigoto, mientras que las divisiones mitóticas lentas de la blástula dan lugar a la gástrula.

En el proceso de formación de blástula, las células no se mueven. Sin embargo, durante el proceso de formación de la gástrula, las masas celulares se mueven a través de movimientos morfogenéticos.

A diferencia de la blástula, hay tres capas germinales distintas que están presentes en la gástrula.

Dado que cada uno está presente en diferentes etapas de la embriogénesis, la blástula se conoce como el «pre-embrión», mientras que la gástrula se conoce como el «embrión maduro».