La diferencia clave entre el citoplasma y el protoplasma es que el citoplasma es una parte del protoplasma que no incluye el núcleo, mientras que el protoplasma es el contenido vivo de una célula que incluye el citoplasma y el núcleo.

El citoplasma es un líquido coloidal, translúcido y homogéneo, que consta de orgánulos, proteínas, reservas de alimentos y desechos metabólicos que rodean el núcleo. A diferencia del protoplasma, el citoplasma no incluye el núcleo. El principal compuesto del citoplasma es el agua. Además de agua, también contiene proteínas, carbohidratos, sales, desechos, gases, etc. El pH del citoplasma es de alrededor de 6.6, que es bastante ácido.

El protoplasma es la masa celular compleja gelatinosa en la que tienen lugar numerosas actividades biológicas y químicas en una célula viva. Por lo tanto, es la parte viva de la célula y la base física de la vida. Generalmente, el protoplasma contiene de 70% a 90% de agua, y el resto son sales minerales, proteínas, carbohidratos y lípidos. Sin embargo, dependiendo del tipo de célula, la composición puede variar ampliamente. El protoplasma difiere del citoplasma ya que contiene el núcleo.