La diferencia clave entre el exoesqueleto y el endoesqueleto es que el exoesqueleto es un esqueleto externo presente fuera del cuerpo de un animal, mientras que el endosqueleto es un esqueleto interno presente dentro del cuerpo de un animal.

El cuerpo de un organismo vivo, ya sea una abeja o un ser humano, es una red compleja de diferentes órganos. Estos órganos realizan varias funciones propias además de estar conectados entre sí.

El exoesqueleto se ubica fuera del cuerpo, mientras que el endoesqueleto se localiza dentro del cuerpo. El esqueleto externo protege y también apoya el cuerpo del animal. Por otro lado, el endoesqueleto brinda apoyo y protección a los órganos más blandos y frágiles internos como el corazón, los pulmones, los riñones, etc.

El exoesqueleto y el endoesqueleto difieren principalmente entre sí por la ubicación del cuerpo donde se ubica. El exoesqueleto se deriva del ectodermo, mientras que el endoesqueleto se deriva del endodermo o mesodermo.

El endoesqueleto tiene médula ósea que ayuda a producir células sanguíneas mediante el proceso de proliferación endotelial del cuerpo, mientras que esta característica no está presente en el exoesqueleto.