FAT32 y NTFS son sistemas de archivos utilizados en un sistema operativo. NTFS es el sucesor del FAT32 que se usa en versiones de sistemas operativos como Windows NT y 2000 y sus versiones posteriores, mientras que FAT32 es la versión más antigua de los sistemas de archivos y se usa en versiones anteriores del sistema operativo como DOS y las versiones anteriores de Windows XP.

FAT32 es simple, mientras que la estructura NTFS es bastante compleja.

NTFS puede admitir tamaños de archivo y volumen más grandes junto con nombres de archivos grandes en relación con el sistema de archivos FAT32.

FAT32 no proporciona ni cifrado ni mucha seguridad, mientras que NTFS está habilitado con seguridad y cifrado.

Es bastante fácil convertir un sistema de archivos FAT en otro sin perder datos. En contraste, la conversión NTFS es difícil de lograr.

El rendimiento de NTFS es comparativamente mejor que FAT32 ya que también proporciona tolerancia a fallas.

Se accede a los archivos más rápido en el caso de NTFS. Por el contrario, FAT32 es más lento que NTFS.

En resumen, entre los sistemas de archivos FAT32 y NTFS, el sistema de archivos NTFS es una tecnología más nueva que proporciona más funciones en comparación con FAT32, como confiabilidad, seguridad, control de acceso, eficiencia de almacenamiento, etc. Aunque FAT32 todavía está en uso debido a su compatibilidad.