La fisión en física nuclear y química nuclear es un proceso en el cual un núcleo atómico se divide en dos o más núcleos, mientras que la fragmentación en química es la disociación de iones de una molécula.

Otra diferencia significativa entre la fisión y la fragmentación es que la fisión es importante para la producción de energía nuclear, mientras que la fragmentación es útil para la espectrometría de masas, para la identificación de la estructura y el peso molar de una molécula.