El virus de la hepatitis B está en el género Orthohepadnavirus (Familia Hepadniviridae), mientras que el virus de la hepatitis C está en el género Hepacivirus (Familia Flaviviridae).

El tiempo de incubación para la hepatitis B es de aproximadamente 90 días en comparación a los 45 días de la hepatitis C.

Si bien la hepatitis B es comúnmente transmitida sexualmente, este no es el caso de la hepatitis C, que rara vez se transmite sexualmente.

La hepatitis fulminante es un resultado común de estar infectado con el virus de la hepatitis B, pero no es un resultado común de estar infectado con el virus de la hepatitis C.

Hay dos vacunas disponibles para la hepatitis B, no hay ninguna vacuna disponible para la hepatitis C.

La hepatitis B parece estar asociada con la poliarteritis nodosa, mientras que la hepatitis C parece estar asociada con la porfiria cutánea tardía y la crioglobulinemia.