La esterasa y la lipasa son dos enzimas importantes en la hidrólisis y la digestión de los lípidos. De hecho, la lipasa es una enzima que pertenece a un subconjunto de esterasas.
La diferencia clave entre la esterasa y la lipasa es que la esterasa cataliza la hidrólisis de los ácidos grasos de cadena corta, mientras que la lipasa cataliza la hidrólisis de los ácidos grasos de cadena larga.
La esterasa actúa principalmente sobre sustratos solubles en agua, en cambio la lipasa actúa principalmente sobre sustratos insolubles en agua.
La esterasa contiene menos cantidad de aminoácidos hidrófobos que la lipasa.
Las esterasas muestran una alta especificidad de sustrato y una alta estereoespecificidad en comparación con las lipasas.