Los lirios pertenecen al género Lilium de la familia Liliaceae. Este género incluye 109 especies de lirios, así como una variedad de híbridos y cultivares desarrollados por horticultores.

Las orquídeas pertenecen al género Orchis de la familia Orchidaceae y hay entre 21,950 y 26,049 especies.

Como la familia de las orquídeas es tan grande y diversa, algunas orquídeas parecen lirios, lo que hace que diferenciarlas sea aún más difícil. Esta tarea se hace aún más difícil por el hecho de que algunas flores se llaman coloquialmente lirios, pero en realidad no lo son en absoluto. Esto incluye el lirio de agua, el lirio del fuego, el lirio del Nilo, el lirio de la trucha, el lirio kaffir, el lirio de la cobra, el lirio del valle, el lirio de día, el lirio de jengibre, el lirio del Amazonas, el lirio peruano, el lirio peruano, entre otros.

Solo hay una diferencia verdadera entre un lirio y una orquídea. Un lirio tiene estambres largos y la orquídea, por otro lado, carece de estos estambres y tiene una columna sólida en el centro de la flor que contiene el polen.

También hay algunas diferencias habituales en la forma de la flor o en los bulbos y raíces. Sin embargo, nuevamente estas diferencias pueden ser superficiales y depender de la especie particular que se está diferenciando.