Tanto el mesénquima como el ectomesénquima se desarrollan en el mesodermo y el ectodermo, respectivamente.
El mesénquima contiene células sueltas que dan lugar a tejidos conectivos, huesos y cartílagos.
El ectomesénquima se restringe al desarrollo de los tejidos conjuntivo, óseo y cartilaginoso de la región craneal.