El SIDA es la etapa final de la infección por VIH.
Las enfermedades autoinmunes son una respuesta inmune adaptativa contra los antígenos propios.
El SIDA es causado por el virus del VIH, en cambio las enfermedades autoinmunes son causadas por antígenos exógenos o endógenos que activan el sistema inmunológico del cuerpo.
El SIDA se transmite de persona a persona a través de los fluidos corporales, mientras que las enfermedades autoinmunes no son transmisibles.
En el SIDA no hay predisposición genética, mientras que si la hay en las enfermedades autoinmunes.