La diferencia principal es que para hacer harina de trigo integral se muelen las tres capas de la baya de trigo limpia; el salvado, el germen y el endospermo. Para hacer harina de todo uso, el salvado y el germen se eliminan y solo se tritura el endospermo.

Esto también significa que la harina de trigo integral es mucho más rica en nutrientes que la de uso múltiple.

Además de ser más rica en nutrientes, la harina de trigo integral también tiene cuatro veces más fibra y proporciona más potasio, zinc y magnesio.

La harina de trigo integral también tiene un mayor contenido de proteína (14%) en comparación con la harina para todo uso (10%), y menos calorías.

La harina de trigo integral es mucho más densa que la de uso general y se usa comúnmente en pan y otros productos horneados densos, la de uso general se usa mejor para postres con una textura más desmenuzable.

El trigo integral no se puede usar realmente en pasteles ya que su densidad significa que absorbe más humedad y puede secar los pasteles.

La harina para todo uso es mucho más versátil que el trigo integral, así como en los pasteles se puede usar en salsas, pudines, etc.