La zoospora es una espora asexual flagelada producida por protistas, bacterias y hongos, donde el flagelo proporciona motilidad a la zoospora.
La zygospora es la etapa diploide del ciclo reproductivo de muchos hongos y protistas formados por células haploides mediante fisión nuclear.
Además, zoospora es una estructura haploide mientras que zygospore es una estructura diploide.
Es importante destacar que las zoosporas son móviles debido a la presencia de flagelos, mientras que las zigosporas no son móviles ya que no hay flagelos presentes en ellos.