Stanley Martin Lieber nació el 28 de diciembre de 1922 en la ciudad de Nueva York y fue hijo de los inmigrantes rumanos Celia y Jack Lieber.
Con parte de su infancia transcurrida durante la Gran Depresión, Lieber y su hermano menor, Larry, vieron a sus padres esforzarse por sobrevivir para la familia.
Lieber, quien más tarde acortó su nombre a «Lee» como escritor, fue contratado como asistente de oficina en Timely Comics en 1939 y se convirtió en editor interino de la compañía a principios de los años cuarenta. Lee también sirvió en el ejército en el país durante la Segunda Guerra Mundial, trabajando como escritor e ilustrador.
Trabajó para la compañía que eventualmente se convertiría en Marvel Comics. Con el artista Jack Kirby, Lee lanzó Los 4 Fantásticos en el año 1961, y pronto se encargó de crear personajes populares como Spider-Man, X-Men, Hulk y Thor. Lee más tarde trabajó en una serie de empresas de negocios y multimedia relacionadas con el cómic.