Más del 90% de la población es musulmana, y las sectas Tijaniyya, Senussi y Hamalista son las más influyentes. Las ciudades islámicas de Say, Kiota, Agadez y Madarounfa son consideradas sagradas por las comunidades islámicas locales, por lo que la práctica de otras religiones en esas ciudades no se tolera tan bien como en otras áreas. Los cristianos, incluidos católicos y protestantes, constituyen menos del 5% de la población y tienden a concentrarse en Maradi, Niamey y otros centros urbanos con poblaciones de expatriados. Los bahá’ís son muy activos y representan un pequeño porcentaje de la población en general, también están ubicados principalmente en Niamey y en comunidades en el lado oeste del río Níger, en la frontera con Burkina Faso. Las religiones indígenas tradicionales también son practicadas por un pequeño porcentaje de la población.
La constitución establece la libertad de religión y ninguna religión en particular se designa como una religión estatal. Sin embargo, la Asociación Islámica tiene capacidad de asesoría oficial en asuntos religiosos para el gobierno. La constitución prohíbe la formación de partidos políticos basados en doctrinas religiosas. Las organizaciones religiosas están registradas en el Ministerio del Interior. Ciertas fiestas cristianas y musulmanas son oficialmente observadas.