El ADN mitocondrial está presente dentro de las mitocondrias, mientras que el ADN del cloroplasto está presente en los cloroplastos.
El ADN mitocondrial humano contiene 16,569 pares de bases, mientras que el ADN del cloroplasto contiene de 120,000 a 170,000 pares de bases.
El genoma mitocondrial contiene 37 genes, mientras que el genoma de cloroplasto contiene aproximadamente 200 genes.