La diferencia clave entre las microesporas y el grano de polen se basa en el gametofito.

La microspora se convierte en el gametofito masculino, mientras que el grano de polen contiene el gametofito masculino.

Las microesporas se desarrollan solo a través de la meiosis, mientras que los granos de polen se desarrollan a través de la meiosis y luego se someten a la mitosis.

Además, una diferencia adicional entre las microesporas y el grano de polen es que, aunque ambas células son de naturaleza haploide, las microesporas son unicelulares, en cambio los granos de polen son multicelulares.