Aunque alrededor del 90% de Botswana está cubierto por algún tipo de sabana, incluso el desierto de Kalahari contiene vegetación adecuada para sustentar a decenas de miles de animales salvajes.
Los árboles más comunes son el mopane, el espina de camello (vachellia erioloba), el motopi (árbol del pastor) y el baobab. Botswana es una reserva natural de caza para la mayoría de los animales que se encuentran en el sur de África, incluidos leones, leopardos, guepardos, elefantes, jirafas, cebras, hipopótamos, rinocerontes, búfalos africanos, hienas y 22 especies de antílopes como el duiker (un pequeño antílope con cuernos), el ñu y la gacela son familiares. A principios de 2009 se censaron al menos 164 especies de mamíferos, 184 especies de aves y más de 2100 especies de plantas.