El budismo ha sido la religión del estado desde 1989. Alrededor del 93% de todos los habitantes practican el budismo Hinayana o Theravada. Se cree que la mayoría de la gente también practica algunas formas de animismo. Los chinos y la mayoría de los vietnamitas en Camboya practican una mezcla tradicional de budismo mahayana, taoísmo, confucianismo, culto a los antepasados ​​y animismo. A principios del siglo XXI se contabilizaron alrededor de 700.000 musulmanes, representando las cuatro ramas: Shafi, Wahhabi, ImanSan y Kadiani. Menos del 1% de la población es cristiana, con más de 100 organizaciones representadas. También hay pequeños grupos de la religión vietnamita Cao Dai y los bahá’ís.

La constitución establece la libertad de religión y, según los informes, el gobierno respeta este derecho en la práctica. Todos los grupos religiosos se registran a través del Ministerio de Cultos y Asuntos Religiosos para construir lugares de culto y realizar actividades religiosas libremente.