Los somalíes son principalmente musulmanes sunitas de la secta shafi’i. Según la tradición, sus antepasados eran del linaje Qurayshitic del profeta Muhammad. Excepto por un pequeño número de urbanitas influenciados por la educación superior, todos los somalíes pertenecen a una de las siguientes hermandades: Qadiriyyah, Salihiyyah, Ahmadiyyah y Rifaiyyah. Como musulmanes, se adhieren a la ley de la Shariah siempre que no entre en conflicto con el derecho consuetudinario local. Existe una comunidad cristiana pequeña, de perfil extremadamente bajo.