Según un censo de principios del siglo XXI aproximadamente el 80% de la población afirmaba ser cristiana, con el mayor grupo de iglesias cristianas vinculadas a las iglesias africanas independientes. Estas incluyen la Iglesia Cristiana de Sión (que representa alrededor del 11% de la población) y la Iglesia Apostólica (alrededor del 10% de la población), así como algunas ramificaciones pentecostales que se fundaron como escisiones de varias iglesias misioneras, o las llamadas iglesias etíopes. Las iglesias holandesas constituyen aproximadamente el 7% de la población e incluyen las iglesias Nederduits Gereformeerde, Nederduitsch Hervormde y Gereformeerde. La siguiente denominación más grande fue la Iglesia Católica Romana con un 7% de la población, seguida por los Metodistas con el 7%, los Anglicanos con el 4%, los luteranos con el 2,5%, los Presbiterianos con el 2%, los Bautistas con el 1,5% y los Congregacionalistas con el 1%.

Alrededor del 1% de la población es hindú y otro 1,5% es musulmana, y la mayoría de los seguidores son de ascendencia india. Hay un número muy pequeño de judíos, budistas, confucianos y rastafaris. Alrededor del 15% de la población no reclama afiliación religiosa formal, pero muchos de estos individuos practican las costumbres indígenas tradicionales, incluida la veneración de los antepasados ​​fallecidos y el uso de hierbas, técnicas terapéuticas e incluso magia negra para manipular los poderes de los espíritus. Hay algunos que combinan las prácticas tradicionales con el cristianismo.

Aunque no hay una religión estatal, las fiestas cristianas son oficialmente observadas. Las relaciones entre la mayoría de los grupos religiosos son amistosas. El Consejo de Iglesias de Sudáfrica es un grupo interreligioso que promueve el entendimiento mutuo entre las religiones y mantiene buenas relaciones con el gobierno.