El Islam es la religión del estado. Según las cifras de principios del siglo XXI los musulmanes representan alrededor del 64% de la población total, y se cree que la mayoría son musulmanes sunitas. Alrededor del 30 al 35% de los ciudadanos musulmanes son de la rama chiíta. La población cristiana incluye entre 250.000 y 500.000 personas. Los grupos católicos incluyen las congregaciones católica romana, maronita, copta, armenia, griega, malabar y malankara. Los grupos ortodoxos incluyen la iglesia griega, armenia, copta, india y siria. La Iglesia Evangélica Nacional (Protestante) tiene alrededor de 20,000 miembros. Otros grupos religiosos incluyen hindúes, bahá’ís, sikhs y budistas.

La constitución establece la libertad de religión, pero este derecho está limitado en algunos casos por el gobierno, ya que las prácticas religiosas no pueden entrar en conflicto con la política pública o la moral.