Alrededor del 47% de la población son musulmanes. Los kazajos, un grupo étnico distinto que se originó con los colonos turcos y mongoles que llegaron allí en la antigüedad tardía (primer siglo a. C.), son el grupo dominante en la población y son principalmente musulmanes sunitas de la escuela de Hanafi. El Islam había sido adoptado por los kazajos desde 1043, pero muchas de sus prácticas religiosas populares no se hicieron comunes hasta finales del siglo XVIII. Los uzbekos, uigures y tártaros (que en conjunto representan menos del 10% de la población) también son principalmente musulmanes sunitas. Otras escuelas representadas son Shafit Sunni, Shiite, Sufi y Akhmadi.
Alrededor del 33% de la población son ortodoxos orientales. Hay varias congregaciones protestantes, entre ellas luteranas, testigos de Jehová, pentecostales y adventistas del séptimo día. También hay una pequeña comunidad judía. Alrededor del 2% de la población son católicos romanos.
La constitución establece la libertad de religión, pero existen algunas restricciones impuestas a los grupos religiosos no tradicionales. Todos los grupos deben registrarse con el gobierno para obtener un estatus legal.